第1档高校
国家优先发展大学，共2所：北京大学、清华大学。
“985工程”最初只有北大和清华被确认为要建设“世界一流大学”，并且两校分别获得教育部18亿的拨款额度。因此将这2所学校定位为第一档次高校——“国家优先发展大学”。
第2档高校
国家重点建设大学，共7所：南京大学、复旦大学、浙江大学、哈尔滨工业大学、上海交通大学、中国科技大学、西安交通大学。
这7所大学连同北大、清华都是1999年就被确定的首批“985工程”建设高校。2009年10月9日至10日，在西安交通大学举行第七届一流大学建设系列研讨会。来自首批985高校的9所大学暨北京大学、清华大学、中国科学技术大学、浙江大学、南京大学、复旦大学、上海交通大学、西安交通大学、哈尔滨工业大学(含威海校区)校长(或党委书记、副校长)，经过讨论，决定学习美国常春藤和英国罗素盟校、澳大利亚G8模式，成立学术联盟“九校联盟”，旨在互相借鉴对方的优势学科，共同发展，会上签订了《一流大学人才培养合作与交流协议书》。即中国首个顶尖大学间的联盟——九校联盟(C9)。因此将这7所学校定位为第二档次高校——“国家重点建设大学”。
第3档高校
除前面2个档高校之外的副部级985工程大学，共23所(前面两个档的9所高校都是副部级大学，加一起共32所)。
所谓副部级大学，就是说他们的校长、书记等高层领导由中央组织部任命而非教育部任命的大学。一般学校介绍时说“中央直管”，就是副部级大学，也称副部级高等学校(简称“副部级高校”)、中央直管高校等。
虽然由于现在高校去行政化的改革，副部级大学已经取消，所以大学校长都没有官阶，这个概念已经是过去式了。但是在中国社会，根深蒂固的观念使得一个单位的行政级别是相当重要的。一所高校的行政级别不仅可以反映该校的的办学实力和水平，而且还可以反映出该院校在中央心目中的地位。同是985工程大学，副部级的高校比正厅级高校实力更强，在国家的地位更高。因此本文将非九校联盟的23所副部级985工程大学列为第3档高校。
第4档高校
非副部级(正厅级)985工程大学，共7所：东北大学、中国海洋大学、湖南大学、华南理工大学、电子科技大学、华东师范大学、中央民族大学。
这7所大学虽然也都是985工程大学，但是它们却不是“副部级高校”，故列为第4档高校。
第5档高校
“特色985”大学，共36所。
“特色985”指的是“985工程优势学科创新平台”。 截至2011年年末，985工程共有39所高校。此后，教育部表示“985”工程和“211”工程的规模已经稳定，将不会再新增高校，于是引入动态竞争机制，在非985工程高校且是部属211高校实施“985工程优势学科创新平台”。
985工程优势学科创新平台相当于一个Ⅰ类985工程科技创新平台，其建设方式采用“985工程”大学科技创新平台建设模式，与“985工程”同期执行，每期获得的中央财政资金额度与“985工程”高校接近，其中央财政专项资金额度以年度项目预算批复为准。
“特色985”高校基本上是没有经历过合并重组的行业特色型大学，学科精度极高，拥有一至两个全国顶尖的学科，在行业内认可度极高，具有深厚的行业底蕴和学科积淀。只有国家中央部委直属的“211工程”高校才有资格入选该项目。
“特色985”高校由两部分组成：常规立项高校33所，教师教育创新平台高校3所(东北师范大学、华中师范大学、陕西师范大学)。本文将这36所高校列为第5档高校。
第6档高校
除前面5个档高校之外的部属211工程大学，共9所。
部属高校即中华人民共和国中央部门(单位)直属高等学校。在112所211工程大学中，有84所是部属高校;其中前文所述的5个档次75所高校均为部属高校，本文将剩下的9所部属211工程大学列为第6档次高校。
部属高校与非部属的地方性高校相比有什么不同呢?全国政协委员、河南大学校长娄源功在今年3月7日全国政协民盟的联组会议上发言时说：“在全国800多所本科高校中，有三支队伍，中央财政拿钱的(即部属高校)，地方财政埋单的(即非部属的地方性公办高校)，还有民办的。如果把它们比作高等教育的中央军，地方军和游击队，那么河南就没有一支纯正的中央军，我所在的河南大学只是地方军。”(因为整个河南省没有部属本科院校)
全国人大代表、贵州大学校长郑强就遭受过这种待遇的“落差”。以前担任浙江大学党委副书记时，他三天两头就要去教育部开直属大学会议，为此常常发愁“开会多”，如今却要为 “没会开”而发愁了——“到贵州大学两年了，教育部的会我一次都没权利参加，我的声音都传不到那儿去。一个直接的结果是，离部委远的高校，自己碗里肉也就少了许多。”由此可见，部属高校与非部属的地方性高校相比是有很大的优势的。
第7档高校
211工程大学中除后面第8档5所高校外的非部属大学，共23所。
在211工程大学有28所高校是省属而非部属的高校。由前文可知，与部属高校相比，这些院校是有差距的。本文将非国家照顾性质的非部属211工程大学列为第7档高校。
第8档高校
国家照顾性质的211工程大学，共5所：宁夏大学、海南大学、青海大学、石河子大学、西藏大学。
这5所高校是最后一批(第四批，2008年)入选“211工程”的大学。具有国家政策照顾性质。也就是说这5所高校的办学实力和水平本来是达不到211工程大学水平的，但是考虑到高水平大学的合理布局，每个省(直辖市、自治区)至少要有1所211工程大学，就这样这5所大学才进入211工程大学之列。
具体分类请以教育部官方公布信息为准。
